第1部分第2部分第3部分第4部分
序一序二序三凡例寒性药品苦参升麻葛根柴胡前胡甘草黄连黄芩黄柏知母干地黄熟地黄芍药（白赤）大黄青皮枳壳枳实猪苓泽泻木通栝蒌桑白皮葶苈子滑石薄荷防风天门冬麦门冬牡丹皮红蓝花苏木栀子桃仁连翘地榆石膏马兜铃枇
叙言卷一调经古今方十九首种子时方三首外备方三首卷二胎前金匮方八首时方九首卷三产后金匮方论一十一首卷四杂病金匮方一十九首外科眼目瘰乳痈乳岩（附）乳缩乳卸附∶妇人阴挺论续记
环周图说难上卷本输穴说难手太阴肺经五穴一、少商（井穴）二、鱼际（荥穴）三、大渊（俞穴）四、经渠（经穴）五、尺泽（合穴）手阳明大肠经六穴一、商阳（井穴）二、二间（荥穴）三、三间（俞穴）四、合谷（原穴）五
妙一斋医学正印种子编
总论出产择地土收采按时月藏留防耗坏贸易辨假真咀片分根梢制造资水火治疗用气味药剂别君臣四气五味七情七方十剂五用修合条例服饵先后各经主治引使用药法象卷之一草部上人参黄耆甘草白术生干地黄当归牛膝黄精远志石菖
卷一妇女逐年经症室女十三四岁行经室女十五六岁妇女十七八岁妇人十九二十嫁出时妇人二十一二妇人二十三四妇人二十五六妇人二十七八妇人二十九三十妇人三十四五妇人三十六七妇人三十八九妇人五十一二卷二诊妇人有孕论
顾序慎柔师小传师训题辞卷一师训第一历例题辞卷二医劳历例第二虚损门题辞卷三虚损第三脉法损脉致病次序损脉损症治损法五脏逆传致病诀虚损死证寒热论五脏致伤虚损致病之由亢则害承乃制论虚损误药之辨虚损秘诀损病汤药
脏腑虚实标本用药式
序卷一论疮疡二十六脉所主（一）论疮疡五善七恶主治（二）论疮疡当明本末虚实（三）论疮疡用针宜禁（四）论疮疡欲呕作呕（五）论疮疡用汗下药（六）论疮疡围寒凉之药（七）论疮疡泥用定痛散（八）论疮疡用生肌之药（