叙言卷一脏腑经络先后病脉证第一痉湿病脉证第二卷二百合狐惑阴阳毒病证治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证并治第五卷三血痹虚劳病脉证并治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七卷四奔气病证治第八胸痹心痛短气病脉证
序一序二卷一运气（上）太极图论阴阳体象五行生成数解五行统论每日气数百刻六千分解四季日躔宿度昼夜长短刻数二十四气七十二候斗纲解十二辰次六合解二十八宿过宫歌二十八宿说中星岁差考奎壁角轸天地之门户说气数统论
自叙第一册·诸中门卒中暴厥中风中寒中暑中湿中气中食中恶五绝第一册·诸伤门伤暑伤湿伤燥伤饮食伤劳倦虚劳传尸劳第一册·寒热门发热潮热恶寒往来寒热外热内寒外寒内热上热下寒上寒下热疟厥第二册·诸气门诸气郁痞水
魏序林序自序卷一真中风症中风四言脉诀各症方药中风续论类中风症虚痨虚痨续论脉法方治虚痨不治证卷二咳嗽脉法采《圣济》五脏诸咳嗽痰饮喘促实喘方虚喘方脉息哮症惊悸脉息方药血症脉息喻嘉言龙雷之火论卷三遗精诊法赤
鲙残篇
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分第6部分
曹序自序序例卷之一·阴阳脏腑部阴阳五脏卷之二·阴阳脏腑部诊法通论诊虚实法、诊寒热法（俱入治法）诊病传变（诊病将死期入诊生死条）诊病愈剧诊生死诸脉诊病杂法诊一岁病证相同卷之三·阴阳脏腑部治法通论倒仓法药
序论痘疹受病之由论痘疹治法类集痘疹已效名方附方附：
万氏家传养生四要
吴序张序自序张声驰序卷上人身一小天地论阴阳互根论五行生克论阴阳治法大要论枢机论卫气行度一经星经天论营气行度一经水行地论百病提纲论望病须察神气论卷中闻声须察阴阳论问证求病论切脉源流论内伤大要论湿气论卷下