第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分
首序自序性命篇上性命篇下补遗篇一补遗篇二辟邪篇太极图说注解序周子太极图（缺）无极而太极后跋
刘序鲍序程序自序初集许静亭翁夫人产后感邪重用清下治验刘明府少君先天不足心脾内亏治法鲍觉生宫詹郁伤心脾证类噎隔殆而复生洪楚峰孝廉中脏殆证再生奇验方萃岩翁公郎滑精证治余氏子疟后变证汪典扬翁外孙女体弱感邪证
金匮方歌括
第1部分第2部分第3部分
类证普济本事方
简介序卷上卷下
序序刻孙真人眼科秘诀序卷之一孙真人眼科总理七十二症秘诀冲和汤玄灵圣方制炉甘石药开明汤十大将军冲翳散揭障丹十二将军二圣散论二圣散扫雾丹制蕤仁之法大决明散赛宝丹调合赛宝丹法补脑还精丸外治烂弦迎风有泪方卷之
玉石部上品丹砂玉泉玉屑云母石钟乳朴硝芒硝硝石玄明粉生硝矾石滑石空青曾青石胆绿青赤石脂白石脂青石脂黑石脂黄石脂白石英紫石英禹余粮太一余粮无名异绿矾柳絮矾婆娑石中品雄黄石硫黄雌黄食盐水银石膏金屑银屑生银灵
正文以上发明病根，是本段之前半截。下乃备引经义，以证其实而足其理。以上论理升降出入，是病机也。推病根，为第二段。以上推论化气，发明标本，是补足前半篇义理，为第三段。以下论五味补泻治法，退出通篇，为第四